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10x单细胞转录组测序CRO科研服务
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10x Atera预售继续 | 一张切片解锁空间组学新纪元:全转录组+高通量+单细胞分辨率

11 人阅读发布时间:2026-09-21 16:18

10x Atera 开启空间组学新纪元

一张切片即享全转录组、高通量与单细胞分辨率

空间组学长期面临「不可能三角」(大视野、高分辨率、全转录组无法兼得),以及灵敏度与通量之间的矛盾。过去的技术总是在通量、灵敏度、基因覆盖之间顾此失彼。而Atera凭借全转录组覆盖、单细胞级灵敏度与高通量灵活性,彻底打破了这一困局,为空间生物学研究提供了全新的可能。

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Atera仪器

号外号外  作为10x Genomics的认证服务商,伯豪生物面向全国科研与临床用户,开放Atera平台首批项目合作名额。

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名额有限,先到先得

 

 

01 Atera技术亮点 全转录组覆盖

Atera检测基因数>18,000(覆盖绝大部分蛋白编码基因),还可额外定制1,000个基因,不再局限于靶向Panel。并且将支持更多物种的检测。

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Atera官方实测数据—临床宫颈癌样本中主要细胞类型的空间定位

单细胞分辨率

基于原位成像及多模态细胞分割技术,像素尺寸约0.2 μm,能够实现真正的单细胞甚至亚细胞分辨率。

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Atera官方实测数据—组织样本分子水平上不同的细胞状态

 

超高灵敏度

多轮独立及技术重复实验验证了Atera的高灵敏度、高特异性、低假阳性水平与高稳定性。

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Atera官方实测数据—验证灵敏度、特异性与稳定性

A.多次实验运行下,组织单个细胞的转录本数量(灵敏度分析)。B. 同一组织中,Atera WTA 与 Chromium Single Cell Flex Apex单细胞技术的基因检出相关性为 r² = 0.75。C. 同一玻片上两次技术重复,细胞转录本数量相关性为 r² = 0.99。

根据10x 官方发布的数据集,对比同一块组织在Xenium v1和Atera的数据,及相同组织类型在Xenium及Atera的数据,Atera的基因中位数及中位转录本数等指标(灵敏度),提升了一个数量级以上,约15倍-20倍。超高的灵敏度可以帮助我们检测组织微环境中新的细胞状态、新的相互作用、稀有细胞类型等。

超大视野,高通量

捕获面积>5cm2/每张,运行最多4张/次芯片,可分析800cm2样本/年,支持:FF、FFPE、组织芯片(TMA)。

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Atera更大视野芯片

多组学拓展

同一切片可实验RNA表达+形态学(H&E染色)检测,未来将支持空间蛋白检测。除全转录组方案外,可定制靶向Panel定制(额外加1,000基因,或自定义2,000基因Panel,自定义3,000基因Panel即将推出),适用于SNV、可变剪切、CRISPR gRNA、病原体序列等检测。

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Atera将支持更多空间组学研究

02 Atera原位空间分析实测数据

近日,10X官方更新了Atera的实测数据。目前的2例数据检测了乳腺癌和宫颈癌的FFPE样本。从结果来看,Atera全转录组检测表现优异,灵敏度与数据产出均大幅优于Xenium。

乳腺癌FFPE样本实测对比

实测样本:WTA Breast Cancer (FFPE),Atera转录本检出与数据产出能力显著优于Xenium。

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Atera官方实测数据—组织样本分子水平上不同的细胞状态

 

宫颈癌FFPE样本实测对比

实测样本:WTA Cervical Cancer (FFPE),Atera依旧表现出高检出、高灵敏度优势。

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从这两个释放的实测数据我们可以看出,相比于Xenium,Atera的全转录组分析方案可全面覆盖18000+编码基因,彻底摆脱Panel限制;其单细胞中位转录本检出量较Xenium提升8–15倍,凭借更高的检测灵敏度、更大的组织捕获面积及更强的数据产出能力,进一步助力更广泛深刻的空间转录组学研究。

 

03 三大空间组学平台技术对比

· Visium HD:空间研究的“发现工具”

基于 NGS 的全转录组方案,适合低成本、大范围探索(如空间图谱构建、差异筛选),是空间发现的“第一步”。但其分辨率是“接近单细胞”(8 μm bin),对不规则或相邻细胞区分有限。

· Xenium:空间研究的“验证工具”

基于成像的靶向检测,单细胞级分辨率(0.2 μm),超高灵敏度,能检测到Visium HD“看不到”的信号。Xenium的检测结果可以与免疫组化(IHC)、高通量空间蛋白组数据直接比对,可验证关键细胞类型和信号通路。简单来说,Xenium是把Visium HD的发现拿到单细胞层面去验证、去定位、去深挖。但覆盖基因最多5,000–6,000 个,不适合无预设靶点的发现研究。

· Atera:Xenium的“全转录组升级版”

融合了成像的单细胞分辨率与全转录组覆盖(>18,000基因,可额外定制1,000 基因),单张玻片成像面积>500 mm²,一次运行最多4张玻片,通量大。

Atera填补了Visium HD和Xenium之间的空白,既能像Visium HD一样无偏发现,又能像Xenium一样看清单个细胞。

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