上海伯豪生物技术有限公司 品牌商

15 年

手机商铺

商家活跃:
产品热度:
自营

伯豪生物

技术服务

已认证
品牌介绍
上海伯豪生物技术有限公司(简称SBC)是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心根据国内外研发外包发展的需要,整合旗下系统技术平台、商 业化服务体系、高素质服务团队等资源成立的致力于研发外包服务的全资子公司。 上海伯豪生物技术有限公司拥有五大微阵列芯片服务平台(SBC、 Affymetrix、Agilent、NimbleGen和Illumina芯片平台),三大第二代测序服务平台(ABI SOLiD 5500、Illumina Solexa、和Roche 454测序平台)以及ABI定量PCR、ABI 3730测序等验证服务平台。正在为多达18家跨国制药企业(包括排名前10位的跨国制药企业中的8家)和1133家国内科研机构、医院提供基因表达谱、 基因分型、比较基因组学、DNA甲基化、miRNA、生物信息分析等技术服务。 公司技术平台在获得广大客户青睐的同时,也得到合作伙伴的高度评价,公司不仅是Affymetrix公司在中国第一家认证的服务提供商,同时也是Agilent公司和ABI公司在国内认证的服务提供商,且先后被授予 “Agilent公司亚太区最佳服务供应商”和“Affymetrix公司优秀服务商”称号。
代理

Agilent

生物芯片/实验室仪器 / 设备

已认证
品牌介绍
安捷伦是全球测量领域的领导者。当测量至关重要时,安捷伦为工程师、科学家、制造商、企业、研究人员和政府机构提供多种工具和解决方案。从家庭娱乐到国土安全,从食品安全到网络可靠性,从无线通信到发现疾病遗传基理,安捷伦提供多种测量工具来提高用户的工作效率,并使全球成为更加安全、更加健康、更适合人类居住的乐土。没有一家公司可以提供如此广泛、先进的测量工具和专业知识,来满足全球电子和生物分析测量领域的严格要求。安捷伦公司历史悠久,并始终致力于发展测量技术,无论从任何角度衡量,都是当之无愧的全球行业领导者。
品牌商

上海伯豪生物技术有限公司

入驻年限:15 年

  • 联系人:

    Mr chong

  • 所在地区:

    上海

  • 业务范围:

    体外诊断、实验室仪器 / 设备、细胞库 / 细胞培养、技术服务、论文服务、试剂、耗材

  • 经营模式:

    生产厂商 科研机构 经销商 代理商

在线沟通

公司新闻/正文

文献解读 | 接受生物制剂治疗的银屑病患者矛盾性湿疹的综合蛋白质组学和基因组学分析

人阅读 发布时间:2024-07-05 11:16

期刊:Allergy 
影响因子:12.4
主要技术:Olink蛋白组学

导语

本研究旨在探讨银屑病患者在接受生物疗法时发生矛盾性湿疹(paradoxical eczema)的免疫学和遗传风险因素。使用Olink蛋白组学分析71名银屑病和矛盾性湿疹患者以及75名银屑病对照者的256个血清样本进行分析,以识别差异表达蛋白质和富集的基因集。病例样本在生物疗法前(T1)、后(T2)和矛盾性湿疹发生后(T3)与对照样本进行了1:1匹配。选取了富集基因集有贡献的基因,并利用88名矛盾性湿疹病例和3124名银屑病对照的基因型数据,创建了多基因风险评分。结果显示,T1组的STAMBP蛋白表达低于对照组,而在其他时间点未发现其他蛋白质有统计学差异。在T2和T3时,分别有11个和10个基因集在病例组中富集,涉及细胞因子和趋化因子通路。在39种有助于富集基因组的蛋白质中,大多数与特应性皮炎血清蛋白质组有关。
 

主要技术

Olink蛋白组学
 

研究结果

1. 研究队列及患者特征

研究收集了71名银屑病和矛盾性湿疹患者以及75名银屑病对照者的256个血清样本。为分析和比较患有矛盾性湿疹的患者与对照组在基线和生物制剂暴露后的系统性炎症特征,研究采用了时间序列分析,对3个时间点的血清使用Olink Target 96 炎症panel进行蛋白检测,三个时间点为生物疗法前(T1)、生物疗法后(T2)和矛盾性湿疹发生后(T3),与对照样本进行了1:1匹配(表1)。

表 1

2. 蛋白差异表达分析

分析共确定16种差异蛋白,在所有时间点中,病例组的STAMBP表达均低于对照组,但仅在T1时有统计学意义。其余15种蛋白质在生物暴露后发生了显著变化,但在病例和对照组之间水平相似(图1)。

图 1

3. GSEA富集分析

进一步使用GSEA分析来确定在不同时间点(T1、T2、T3)病例相对于对照组是否存在功能相关基因集的富集情况。结果发现,在T1时间点没有发现基因集富集,在T2和T3时间点分别发现了11个和10个富集的基因集(图2)。T2和T3时间点富集的基因集类型相似,涉及细胞因子信号、趋化因子信号和IL10信号等途径。

图 2

4. 蛋白与AD疾病的关系

进一步分析识别对富集基因集贡献最大的39种蛋白质,并总结了他们的功能,以及它们在银屑病、AD、两者都不是或两者都是的患者血清中相对于健康对照组的差异性表达情况。结果发现,这些蛋白质中的大多数AD有关(图3)。

图 3

5. 蛋白与AD转录组的比较

为进一步揭示富集基因集贡献最大的39种蛋白质对应的mRNA在AD病变皮肤和血液中的表达变化,对各时间点的蛋白差异表达倍数与AD血液和皮肤相应的基因差异表达倍数进行比较。结果发现,有7种(CCL13, CXCL10, CXCL1, CXCL11, CCL19, CCL2 、IL20RA)对应的mRNA与AD患者皮肤差异表达,2种(VEGFA 和 TNFRSF11B)与AD患者血液差异表达。值得注意的是,除了IL20RA和TNFRSF11B之外,几乎所有基因在矛盾性湿疹的T3时间点和AD病变皮肤及血液中都表现出了一致的增加趋势(图4)。

图 4

6. 整合蛋白质组学-基因组学分析

研究人员使用来自88例矛盾性湿疹病例和3212例牛皮癣对照组的遗传数据,进一步使用GSEA的结果来指导使用多基因风险评分(PRSs)探索遗传风险。结果确定了矛盾性湿疹和PRSALL之间的关联,PRSALL包含了所有与富集基因集功能相关联的单核苷酸多态性(SNPs)。然后生成十个分区PRS(PRSA-PRSJ),从PRSALL中选择仅包含与特定基因集相关的SNP。结果发现,矛盾性湿疹与7 种PRS之间存在显著关联,这些PRS包含与趋化因子、细胞因子、IL10 和各种类型的G蛋白偶联受体介导的信号传导相关的SNP(表2 )。

表 2
 

参考文献:

Al-Janabi A, Martin P, Khan AR,  et al. Integrated proteomics and genomics analysis of paradoxical eczema in psoriasis patients treated with biologics. J Allergy Clin Immunol. 2023 Nov;152(5):1237-1246. doi: 10.1016/j.jaci.2023.07.011. Epub 2023 Aug 1. PMID: 37536512.
 

上一篇

文献解读 | 活动性系统性红斑狼疮患者的作用机制及生物标志物和关键免疫通路的鉴定

下一篇

硬核分享 | 国内首批GEM-X单细胞数据经验分享

更多资讯

询价列表

暂时没有已询价产品

快捷询价 发送名片
    当你希望让更多商家联系你时,可以勾选后发送询价,平台会将你的询价消息推荐给更多商家。