基于单细胞转录组，空间转录组等技术涉及到的生信分析个性化程度高，分析周期长等问题，伯豪生物特此提供功能实用，操作简单，不需要编程背景即可实现分析的单细胞多组学专项小工具。无需编程背景，只需根据详细的使用指南，即可简单快捷实现组学数据挖掘。

伯豪生信云网址：http://tools.shbio.com/home/index.html

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4. 单细胞多组学专项数据挖掘

（1）Marker基因气泡图
Marker基因气泡图用于展示多个marker基因在不同cluster或不同细胞类群中的表达情况。

（2）基因tSNE/UMAP图

选择感兴趣的基因，在tSNE或者UMAP坐标下，展示其在单细胞中所有亚群的表达情况。颜色越深说明该基因表达量越高。

（3）Marker基因的小提琴图

选择多个marker基因，采用堆叠小提琴图的方式展示单细胞中所有亚群或者细胞类型的基因表达情况

（4）signature基因集表达热图

探究关注的基因集合（如缺氧，自噬，铁死亡等相关基因集合）在不同细胞群中的表达情况，对特定基因集中的基因表达量进行可视化。

（5）基因集打分的tSNE/UMAP图

识别关注的单个基因集或多个基因集（如缺氧，自噬，铁死亡等相关基因集合）在细胞中富集的情况，该工具根据多个基因集中对应基因表达量对每个细胞进行打分（采用GSVA包中的ssgsea打分算法），展示多个功能在细胞中的富集情况。

（6）基因集打分小提琴图

识别关注的多个基因集（如缺氧，自噬，铁死亡等相关基因集合）在细胞中富集的情况，该工具根据多个基因集中对应基因表达量对每个细胞进行打分（采用GSVA包中的ssgsea打分算法），以堆叠小提琴图方式展示多个功能在细胞中的富集情况。

（7）基因集打分热图

识别关注的多个基因集（如缺氧，自噬，铁死亡等相关基因集合）在细胞中富集的情况，该工具根据多个基因集中对应基因表达量对每个细胞进行打分（采用GSVA包中的ssgsea打分算法），热图方式展示多个功能在细胞中的富集情况。

（8）GO富集分析

GO功能富集分析用于探究关注的基因集合（如差异表达基因、cluster特异表达基因）的功能特征。该工具进行富集分析并输出富集分析结果表、富集气泡图和柱形图。

（9）KEGG富集分析

KEGG功能富集分析用于探究关注的基因集合（如差异表达基因、cluster特异表达基因）的通路富集情况。该工具进行富集分析并输出富集分析结果表、富集气泡图和柱形图。

（10）细胞占比分析_堆叠柱形图

细胞占比分析_堆叠柱形图小工具通过堆叠柱形图展示多个样本中所有亚群或者细胞类型的细胞数目或者比例。